国家生物信息中心等联合举办生物信息学实战培训班
7月10日至11日,由国家生物信息中心主办,浙江大学爱丁堡大学联合学院、中国医药教育协会医学基因组学与生物信息学专委会协办的“生物信息学实战:从Linux/R基础到单细胞多组学分析”培训班在浙江大学爱丁堡大学联合学院举办。
本次培训内容涵盖Linux系统操作、R语言绘图、单细胞转录组数据分析以及单细胞免疫组数据分析等多个方面,旨在构建全面的生物信息学知识体系,提升学员在生物信息学领域的实战能力,特别是在单细胞多组学分析方面的技术应用能力。
7月10日,围绕Linux操作系统与R语言绘图基础,张陌尘老师系统讲授了Linux系统概览、终端操作基础、文件操作与权限管理、文本处理与内容提取等核心知识,学员学习掌握了R Studio开发环境配置与应用、数据整理与预处理操作、基于ggplot2的高级图形绘制与分面布局等内容。
7月11日,浙江大学爱丁堡大学联合学院迟颖教授首先作关于人工智能驱动的动态分子结构、前沿组学和相关GPT专业纵深的报告。随后进行了单细胞转录组数据和单细胞免疫组数据的标准分析流程培训,对序列比对、数据质控、降维聚类、鉴定差异表达基因、克隆型多样性差异分析和可视化操作等关键步骤进行了实操训练,现场演示了操作过程中需要注意的问题和需要调整的参数。
单细胞多组学分析实操环节中,李国超老师讲授了如何使用ggplot2进行单细胞转录组数据的可视化,如何从零开始自学R包等基础知识。此外,学员们还掌握了如何按细胞类型鉴定组间差异表达基因及其相应功能通路,以及整合双组学数据鉴定存在差异克隆型的免疫细胞类型等高级技能。
通过高强度学习和实操,学员们不仅提高了独立开展单细胞多组学研究的能力,还掌握了多组学整合分析、疾病机制挖掘等前沿技术,为未来的科研工作打下了坚实的基础。
本次培训不仅为学员提供了开拓视野、提升技能的宝贵平台,更以高水平的学术交流与实践教学为国家生物信息技术体系的人才培养注入了强劲动力。此次国家生物信息中心与浙江大学爱丁堡大学联合学院首次深度合作,让前沿科技与教学实践实现零距离对接。展望未来,国家生物信息中心将不断推出更高质量的培训项目,持续引入前沿学术资源,共同推动领域人才培养和学科发展。
培训现场