报告人： 童贻刚 研究员 

　　         军事医学科学院微生物流行病研究所 

　　主持人： 陈 非 

　　时  间：2014年4月9日（星期三）上午10:00-11:30 

　　地  点：中国科学院北京基因组研究所1层报告厅 

　　报告摘要： 大部分病毒（尤其是噬菌体）都具有线状基因组，了解这些基因组的末端序列特点对于阐明这些病毒的复制机制、包装机制以及病毒的生命周期具有重要意义。由于这些病毒基因组往往具有末端冗余（正向重复），导致在序列拼接时总是形成一个环状的基因组序列，无法判断基因组的起始和终止位点的真正位置，因此必须用复杂的试验来确定基因组的起始和终止位置。本研究利用高通量测序数据，在完成病毒基因组全序列拼接的同时，通过分析测序数据中的高频reads，直接确定基因组的上下游末端序列，获得了数十株病毒的末端序列。同时为了证明此方法的可靠性，我们在病毒基因组末端人工连接接头，然后进行序列测定，所获得的结果与我们预期的结果完全一致。结论：本研究利用高通量测序数据，在拼接全基因组的同时直接确定病毒基因组的末端序列，为病毒基因组分析提供了额外的信息。 

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