基因组所承担的中国科学院重点部署特支项目“南海部分海区重要微生物类群基因组多样性初步研究”完成结题验收
2016年8月15日,中国科学院前沿科学与教育局在北京组织召开了中国科学院重点部署特支项目“南海部分海区重要微生物类群基因组多样性初步研究”结题验收会。验收专家组由来自中科院植物所、微生物所、遗传发育所、首都师范大学、山东大学的7位业务专家,以及来自中国生物技术发展中心的财务专家组成。中科院植物所洪德元院士任专家组组长。会议由中科院前沿局生命科学处沈毅处长主持,基因组所党委副书记王丽萍参加了会议。
该项目由中科院北京基因组研究所和中科院南海海洋所共同承担,张德兴研究员主持。经过3年的研究,项目对从南海不同海域采集和分离的10株放线菌、9株链霉菌进行了全基因组测序、拼接和注释,并通过泛基因组学和功能基因组学分析以及比较进化基因组学分析,发现放线菌专属的一些天然产物(如聚酮类、多肽类、醌类等)的代谢途径,探讨了海洋链霉菌类群对海洋高盐、低温、寡营养生境的适应机制;完成34个海洋站位143个样品的16S rDNA测序,以及45个样品的宏基因组测序和分析,分析了南海海洋细菌群落组成与深度、温度、盐度、磷酸盐和硅酸盐等环境因素的关联性,探讨了微生物群落和功能特征的动态过程及其变化机制;开发了基于新一代测序技术的微生物基因组的高效优化拼接方法的GAP PRIE软件,以及用于对海量微生物基因组数据进行泛基因组特征分析的PanGP软件,并实现了数据和结果的可视化展示;建设包括南海微生物的海洋微生物组学数据库及网站,实现了数据共享与海洋微生物资源的科学普及。项目的完成为今后开发利用海洋微生物资源奠定了基础,同时也加强了对我国南海海区的深入科学研究。
专家组认真审阅结题报告,听取了项目及课题组的汇报并进行了提问和深入讨论。经评定,专家组一致认为该项目很好的完成了既定目标,同意该项目通过验收。专家组表示,中科院在2013年初就部署了该项目,具有长远战略眼光,应继续在已经取得的优势的基础上,进一步加强顶层设计,组织协调队伍,充分发挥中科院的优势,在海洋微生物资源领域研究方面发挥更大的作用。
会议现场