2013年第6期Genomics, Proteomics & Bioinformatics（GPB）纸质版期刊已经出版，共发表文章6篇，包括4篇研究性文章，1篇快报和1篇方法学文章。

　　先兆子痫是指孕妇在怀孕期间，发生血压上升（妊娠型高血压），合并蛋白尿、水肿等现象。研究表明，先兆子痫女性所生女儿罹患乳腺癌的风险降低，但机制尚不清楚。Chung-Cheng Hsieh博士（美国）等采用血浆NanoUPLC-MSE蛋白质组分析方法，比较了先兆子痫孕妇和正常孕妇脐带血数据，发现了包括甲胎蛋白在内的多种差异表达的蛋白，这为深入研究先兆子痫与乳腺癌易感性的关系提供了新的思路。

　　基因组和后基因组技术的飞速发展使我们可以很容易获得大量数据信息，但还需要生物学知识来帮助我们更好地认识相关复杂机制，如了解植物的免疫应答机制可帮助人们高效地进行作物生产经营。Liliana López-Kleine博士（哥伦比亚）等利用现有拟南芥和木薯基因组数据，采用微阵列和RNA-seq相结合的整体分析方法研究了免疫相关基因与其他基因在调控网络中的相互关系，并预测了一些新的免疫相关基因，该方法为免疫应答研究提供了有利的依据证明。

　　为了进一步阐明microRNA在肝癌中的作用，Mahmoud ElHefnawi博士（埃及）等采用新的生物信息学方法对26种肝癌细胞的miRNA进行了目标预测和功能分析，同时还揭示了肝癌致癌信号通路的关系，通过综合分析表明miRNA可分类为肿瘤抑制或肿瘤促成miRNA； 因此一些miRNA可作为治疗靶标，而另一些则可作为治疗剂，miRNA的这一双重角色也正表明了其在细胞自动调节中的积极作用，为microRNA在肿瘤中的作用研究提供了可行的研究方法。

　　基因组学与蛋白质组学是生物医学研究的主要技术，Nichole Reisdorph博士（美国）等通过提供短期的实践操作培训课程，为研究者们提供了很好的学习和锻炼的机会。该培训包括讲座、实验室操作、视频演示、软件操作等等，文章主要就课程细节及参加者对课程的评估进行了描述，证明该培训对研究者申请基金、发表文章都是非常有益的。

　　阴道毛滴虫的翻译起始因子eIF5A（TveIF5A）被广泛认为有羟腐胺赖氨酸、磷酸化及糖基化修饰，已有3个不同的亚型（pI5.2、pI5.3和pI5.5）被报道。María Elizbeth Alvarez-Sánchez博士（墨西哥）等认为不同TveIF5A亚型与其磷酸化修饰有关，于是利用质谱分析法鉴定了这些亚型的磷酸化位点并证明了他们的假设。研究同时表明内源酪蛋白激酶2可能参与了TveIF5A磷酸化修饰。

　　真核生物的蛋白质运输和分选是一个复杂的过程，目前有许多方法利用序列信息来预测蛋白的亚细胞定位。在以往平面或平行结构预测的基础上，Geetha Govindan博士（印度）等介绍了一种利用集成分类器进行蛋白分选分层预测的方法——Bagging with CTD, 经实验验证并与现有方法比较分析，证明该方法精确度高，在获取蛋白质分泌途径的生物学特性研究中可起到十分有效的作用。

　　以上文章全文可在GPB主页 或ScienceDirect数据库中浏览下载，欢迎大家阅读、引用。

　　另外，GPB将在今年4月出版“Ribogenomics”的专刊，由主编于军博士亲自担任Guest editor，欢迎大家积极投稿。

　　附：本期目录

　　Original Research 

　　Screening Preeclamptic Cord Plasma for Proteins Associated with Decreased Breast Cancer Susceptibility 

　　Identification of Immunity-related Genes in Arabidopsis and Cassava Using Genomic Data 

　　An Integrative Meta-analysis of MicroRNAs in Hepatocellular Carcinoma 

　　Hands-on Workshops as An Effective Means of Learning Advanced Technologies Including Genomics, Proteomics and Bioinformatics 

　　Letter 

　　Identification of the Phosphorylated Residues in TveIF5A by Mass Spectrometry 

　　Method 

　　Bagging with CTD - A Novel Signature for the Hierarchical Prediction of Secreted Protein Trafficking in Eukaryotes