2013年第4期Genomics,Proteomics & Bioinformatics（GPB）纸质版期刊已经出版，共发表文章7篇，包括1篇综述，4篇研究性文章，1篇应用说明和1篇会议报告。

　　多形性胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme, GBM）是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，化疗药物烷化剂替莫唑胺（alkylating agent temozolomide）常被用来治疗该疾病，但人体对替莫唑胺的自然或获得性免疫会使治疗失败。Pier Jr Morin博士（加拿大）等就GBM的形成、治疗方法、替莫唑胺耐性的分子机制、如何解决耐药性几方面进行了综述，强调了肿瘤代谢组学在替莫唑胺耐性早期诊断中的作用，为GBM的治疗提供了新的方法，具有重要意义。

　　烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors, nAChRs）与尼古丁依赖性、情绪异常、神经退行性病变及神经保护作用有关，但其蛋白质组学研究还很少。Marina R. Picciotto博士（美国）等利用转基因小鼠模型对α4β2* nAChRs与其他蛋白质的相互作用关系进行了探索，并采用iTRAQ方法进行了蛋白质组学分析。鉴定出了208种能与nAChRs免疫共沉淀的蛋白，其中17种与α4β2 nAChRs显著相关，这为需找新的药理学靶标提供了依据。

　　Roman A. Zubarev博士（瑞典）等介绍了一种新的蛋白质组学分析方法——蛋白质组氨基酸和元素组成成分分析法（Proteome-wide Amino aCid and Elemental composition, PACE），经验证，该方法简单、灵敏，可广泛使用，获得的数据信息量大，有望成为蛋白质组学研究的标准化分析工具。

　　在我所刘斯奇博士指导下，杨蕾博士等利用real-time PCR和质谱多反应监测法检测5种不同的肝细胞系中醛酮还原酶（aldo-keto reductases, AKRs）基因和蛋白表达情况，研究AKRs在肿瘤发生中的作用。结果表明，AKR1C蛋白的高表达与肝肿瘤发生密切相关，HuH7细胞系中AKRs的表达与其它四种细胞系完全不同。该研究首次提供了肝细胞系中AKRs在mRNA和蛋白水平表达的全部定量信息，为目前技术条件下选择临床生物标记物提供了新的思路。

　　研究蛋白质间相互作用关系对药物设计有重要作用。Premendu P. Mathur博士（印度）等研发了一个可用来分析蛋白质间相互作用机制的综合性数据库——PepBind（Peptide Binding Protein Database），包括3100种蛋白质复合物的结构、序列信息及一个可计算蛋白质间相互作用力强弱的计算工具。该数据库可在http://pepbind.bicpu.edu.in/免费使用。

　　特异性等位基因表达与相关顺式作用元件突变和等位基因特异性表观修饰模式有很大关系，也可能与植物中的杂种优势有关系。本刊编委Xiangfeng Wang博士（美国）等通过追踪杂交玉米幼苗组织的特异性等位基因表达模式和表观修饰模式，分析其转录组、组蛋白修饰和DNA甲基化的高通量测序数据，综合卡方检验和泊松分布等数学理论，研发了一种新的计算框架来鉴定特异性等位基因的表达，为相关领域的科学研究提供了很好的计算方法。

　　2013年5月18、19日，在北京召开了“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛，会议由中国科学院国家数学与交叉科学中心主办，共有21位在相关领域取得突出成果的青年学者作学术报告，内容涵盖计算生物学、计算基因组学、新一代测序数据分析与应用、癌症基因组学、表观基因组学、元基因组学、蛋白质组学及系统生物学等研究领域。本刊特别邀请到会议主席王秀杰博士（中科院遗传发育所）和张世华博士（中科院数学与系统科学研究院）为我们撰写了本次会议的会议报告，希望能给大家带来启发，对数学、计算机与生命科学交叉研究与应用实践的迅速发展有促进作用。

　　另外，GPB将在明年2月出版“Ribogenomics”的专刊，由主编于军博士担任Guest editor，欢迎大家积极投稿。

　　以上文章全文可在GPB主页（http://www.elsevier.com/locate/gpb）或ScienceDirect数据库（www.sciencedirect.com/science/journal/16720229）中浏览下载，欢迎大家阅读、引用。