中-沙椰枣基因组叶绿体分析完成相关论文在PLoSONE发表
2010年8月,由中科院北京基因组研究所(简称:基因组所)与沙特王国阿卜杜拉阿齐兹国王科技城(沙特王国的国家科研管理机构和国家科学研究机构King Abdulaziz City for Science and Technology,KACST)共同开展的“中-沙椰枣基因组计划”取得阶段进展,科研人员于近日完成了椰枣基因组叶绿体的基因组测序与分析工作,相关学术论文在PLoSONE杂志发表。
自2008年底该项目启动以来,基因组所不间断地向沙特国王科技城(KACST)派驻了十余名科研骨干,根据前期合作要求,一年多来,在双方的共同努力下,科研人员已经在KACST建立起了一整套基因组和生物信息学实验平台。此次完成的椰枣叶绿体基因分析即由该平台亲自独立完成,其主要是利用新一代454高通量测序仪产出数据,筛选出叶绿体数据,并借助SOLiD Mate-pair数据进行拼接和分析。
同时,该篇学术论文的发表,是“中-沙”两国椰枣项目合作组成立以来发表的第一篇学术论文,它标志着基因组所与KACST(沙特国王科技城)共建的基因组测序与信息平台已经高速运转,并产出高质量的数据和分析结果。这也是国际上首次发布椰枣的叶绿体基因组数据,对植物,特别是棕榈科植物的进化模式研究具有十分重要的意义。同时也对后续椰枣基因组的拼接和分析起到积极意义。
论文链接:http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0012762
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