荣誉研究员

曾长青  ZENG Changqing

专业技术职务: 研究员
职  务: 博士生导师、精准基因组医学重点实验室主任
电子邮件: czeng(AT)big.ac.cn
学科类别: 遗传学 基因组学 生物信息学
学习经历
1978-1982 北京师范大学 生物学系 学士学位
1982-1985 北京师范大学 生物学系 硕士学位
1987-1993 美国阿拉巴马大学伯明翰校区 博士学位
工作经历

1985-1987 北京师范大学 生物学系 讲师

1994-2000 美国贝勒医学院生化与分子生物学系 Research Associate 博士后

2000-2002 美国德克萨斯大学休斯敦医学院 综合生物学与药理学系 助理教授

2002-2006 北京华大基因研究中心 研究员 科研部部长

2003-2006 北京师范大学 特聘讲座教授

2003- 中科院北京基因组研究所 研究员

2010-2013 中科院北京基因组研究所 重大疾病和个体化医疗重点实验室 主任

2014-2022 中科院北京基因组研究所 精准基因组医学重点实验室 主任

主要研究领域

  目前主要致力于用高通量基因组和表观基因组分析以及生物信息学手段回答生物学问题,重点研究方向为肿瘤在内的疾病相关基因定位及其分子通路与调控机制分析,低氧适应等相关基因的群体遗传学研究和基因组功能注释,自然发生和疾病相关的体细胞突变研究等,同时开展精准医学如人群队列分析和肿瘤早期诊断等方面研究。

承担科研项目情况

1. 中科院重点部署项目,中国人群精准医学研究计划,2015-2018,在研,首席科学家。

2. 中国科学院战略性先导科技专项(B类),人群高原环境适应的遗传基础研究,2014-2019,在研,课题负责人。

3. 国家自然科学基金面上项目,细胞倍增过程中体细胞突变积累及表观遗传学变化,2015-2018,在研,主持。

4. 国家自然科学基金重大研究计划集成项目,大规模多态信息的细胞溯祖理论和统计分析方法,2017-2019,在研,参加。

5. 中科院重点部署项目,以通路分析和基因干扰等手段解析肿瘤的调控网络及其关键节点,2013-2015,结题,主持。

6. 科技部863课题,肿瘤的个体化RNA干扰治疗,2012-2015,结题,主持。

7. 自然科学基金重点项目,全球不同高原人群低氧适应与进化的机制研究,2012-2015, 结题,主持。

8. 科技部973课题,近视发生相关视觉信息处理异常的遗传因素研究,2011-2015,结题,主持。

9. 科技部973课题,心脏间隔缺损发生中遗传机制研究,2010-2014,结题,参加。

10. 国家自然科学基金重大研究计划,项目名称:中国人群若干群体的基因组多态性研究,课题名称:中国人遗传背景的基因组多态性组成研究,2009-2012,结题,主持项目及课题1。

代表论著

1. Shao, J. M., Raza, M. S., Zhuoma B. S., Zeng, C. Q*. Evolutionary significance of selected EDAR variants in Tibetan high-altitude adaptations. Science China Life Sciences. doi: 10.1007/s11427-016-9045-7 (2017)

2. Zhang, H. K., Zhao, F. X., Hutchinson, D. S. et al., Zhang, D. K.*, Zhou, X. T. Conjunctival Microbiome Changes Associated With Soft Contact Lens and Orthokeratology Lens Wearing. Immunology and Microbiology. 58(1):128-136 (2016)

3. Li F, Zhang D, Li Y, Jiang D, Luo S, Du N, Chen W, Deng L, Zeng C*. Whole genome characterization of hepatitis B virus quasispecies with massively parallel pyrosequencing. Clinical Microbiology and Infection. (2015) Mar21 (3):280–287

4. Han X, Liu M, Wang S, Lv G, Ma L, Zeng C*, Shi Y. An Integrative Analysis of the Putative Gefitinib-resistance Related Genes in a Lung Cancer Cell Line Model System. Curr Cancer Drug Targets. (2015);15(5):423-34.

5. Xia H, Hu C, Zhang D, Tang S, Zhang Z, Kou Z, Fan Z, Bente D, Zeng C*, Li T. (2015) Metagenomic Profile of the Viral Communities in Rhipicephalus spp. Ticks from Yunnan, China. PLoS ONE 10(3): e0121609. doi:10.1371/journal.pone.0121609

6. Wu J, Li Q, Li Y, Lin J, Yang D, Zhu G, Wang L, He D, Lu G, Zeng C*. A Long Type of TBCK Is a Novel Cytoplasmic and Mitotic Apparatus-Associated Protein Likely Suppressing Cell Proliferation, Journal of Genetics and Genomics (2014), Feb 20;41(2):69-72.

7. Cheng F, Zhang X, Zhang Y, Li C, Zeng C*. Haplo2Ped: a tool using haplotypes as markers for linkage analysis, BMC Bioinformatics,(2011) 12:350.

8. Beall CM, Cavalleri GL, Deng L, Elston RC, Gao Y, Knight J, Li C, Li JC, Liang Y, McCormack M, Montgomery HE, Pan H, Robbins RA*, Shianna KV, Tam SC, Tsering N, Veeramah K, Wang W, Wangdui P, Weale ME, Xu Y, Xu Z, Yang L, Zaman MJ, Zeng C*, Zhang L, Zhang X, Zhaxi P, and Zheng YT (2010). Natural selection on EPAS1 (HIF2α) associated with low hemoglobin concentration in Tibetan highlanders. PNAS, 107 (25): 11459-11464. (* corresponding)

9. Cheng F, Chen W, Richards E, Deng L, Zeng C* (2009). SNP@Evolution: a hierarchical database of positive selection on the human genome. BMC Evol Biol, 9:221.

8. Sun T, Gao Y, Tan W, Ma S, Shi Y, Yao J, Guo Y, Yang M, Zhang X, Zhang Q, Zeng C* & Lin D* (2007). A 6-nucleotide insertion/deletion polymorphism in the promoter of CASPASE-8 gene and susceptibility to multiple types of cancer. Nat Genetics, 39(5):605-613. (* corresponding)

9. Zeng C. as one principal investigator of the International HapMap Consortium (2007). A second generation human haplotype map of over 3.1 million SNPs. Nature, 449:851-861.

10. Zeng C. as one principal investigator of the International HapMap Consortium (2007). Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations. Nature, 449: 913-918

社会任职
2016- 中国老年保健医学研究会精准医学分会 副主任委员
2016- 北京医学会精准医学分会 会员
2016- 科技部精准医疗专项实施方案编写专家组 成员
2013- The Global Alliance in the field of human genomics, the Representative of the Chinese Academy of Sciences(人类基因组全球联盟 中科院代表);
2012- 中国细胞生物学会 染色体基因组和蛋白组学分会,副会长;
2010- 中国人类遗传资源管理专家组,成员;
2002-06,The International HapMap Consortium,Steering Committee member,Representative of the Chinese HapMap Consortium;
2002-06,中华单体型图协作组,负责和召集人
获奖及荣誉

1987 获得CUSBEA奖学金

2002 获得“国家杰出青年科学基金”

2003 获Excellence in Creativity, Li Foundation Heritage Prize, the United States,美国李氏基金会“杰出成就奖”(个人)

2004 入选“首批新世纪百千万人才工程国家级人选”

2007 中国基础研究十大新闻“证实CASP8基因启动子的一个六核苷酸插入缺失多态与多种癌症易感性相关”(林东昕,曾长青)

2009 朱李月华优秀教师奖

2011 教育部自然科学奖一等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用” (排名4/16)

2012 北京市科学技术奖二等奖“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用” (排名4/16)

2014 中国科学院京区“巾帼建功”先进个人