基因组所举行第九期BIG论坛:生物大数据——挑战与机遇
3月11日,由北京基因组研究所主办的第九期“BIG论坛”在基因组所一层报告厅举行,论坛由所长薛勇彪主持。
本次论坛的主讲人是英国欧洲分子生物学实验室-欧洲生物信息学研究所(EBI)所长Ewan Birney博士,报告题目为:生物大数据——挑战与机遇。Birney博士介绍了基因组学学科的发展、生物大数据的飞速增长及面临的机遇和挑战。他同时还向我们介绍了EBI的发展历史、在生物信息学及生物数据库建设方面的主要贡献以及EBI目前的主要研究方向和目前正在研究的基因硬盘项目。该研究项目拟用人工合成的DNA存储文本文档、图片和声音文件等数据。1克DNA能够存储大约2拍字节,相当于大约300万张CD。DNA作为数字存储介质,容量大,读取方便,便于保存,保存时间长等优点。Birney博士向我们展示了用这种方法存储的马丁·路德·金著名演说《我有一个梦想》中时长26秒的片段、一张欧洲生物信息研究所的JPG格式图片、一份关于DNA分子结构的PDF学术论文和一份包含威廉·莎士比亚154首十四行诗等文档。存储这些信息的DNA分子微小如一粒尘土。这项技术使得将全世界3000亿TB的数据,存储到手掌大小的区域成为可能。
报告人Ewan Birney博士现任英国欧洲生物信息研究所所长,他曾参与过人类基因组计划,2000年,他从Sanger中心来到EBI之后,开发了基因组网站Ensembl和收录蛋白质家族信息的数据库Pfam等多个数据库;2003年他参与到DNA元件百科全书项目(Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE)中,担任数据分析方面的主要负责人。报告结束后,Birney博士与科研人员进行了热烈的讨论与交流,现场气氛热烈。
Birney博士作报告