任捷----中国科学院北京基因组研究所

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研究员

任捷 ( REN Jie )
职称:	研究员
职务:	博士生导师
E-Mail:	renjie@big.ac.cn
学科类别:	基因组学，生物化学与分子生物学

学习经历：
	2000年9月－2004年7月南京大学生物技术专业理学学士学位 2004年9月－2010年5月美国纽约州立大学石溪分校生化和结构生物学博士学位

工作经历：
	2018年至今中国科学院北京基因组研究所研究员 2010年至2018年美国冷泉港实验室博士后研究员

主要研究领域：

　　遗传和表观遗传信息在子代精确稳定传递，是维持真核生物体生存的关键。基因组不稳定性影响衰老进程、肿瘤发生和肿瘤细胞异质性，其中表观遗传调控也起着重要作用。有别于DNA损伤修复机制的传统研究，课题组致力于拓展生物体如何通过对不同层次分子事件的调控来避免DNA发生损伤这一前沿领域新方向，阐明维护基因组稳定性的新机制。基因组转录和复制作为染色质生命活动的两个核心事件，传统方法上多作为独立的事件被分别研究，而这两者之间相互作用的重要性正在得到学界越来越广泛的重视。当转录和复制发生碰撞时，被阻滞的复制叉需要被稳定以便再次激活而完成复制，同时被滞留的RNA聚合酶（RNAP）需要被释放而不再成为复制叉前行的阻碍。在病理学上，两者碰撞导致染色体断裂而产生多种脆性位点，是其对基因组不稳定性发生作用的直接反映。在这一新兴的交叉领域，有许多亟待研究和解答的问题，其中通过表观遗传机机制化解复制和转录碰撞是一个创新型角度，其机制也是关键科学问题。对其深入探讨不仅在基础生命科学研究领域，同时对于人类疾病防治策略都具有重要的意义。

　　课题组研究方向主要包括：

　　1.解析转录和复制碰撞中维护基因组稳定性的表观遗传机理及在精准医学中的应用；

　　2.探索RNA介导的染色质调控在干细胞和衰老中的应用；

　　3.研发表观遗传、基因组功能分析的多维组学体系和单分子测序新技术。

　　研究生报考

承担科研项目情况：

1. 国家重点研发计划，“发育编程及其代谢调节”重点专项，糖脂代谢感应及其信号网络的系统剖析，2020/12-2025/11，在研，课题负责人

2. 中国科学院A类战略性先导科技专项，静息期造血干细胞调控器官再生机制研究，2018/9-2022/11,在研，子课题负责人；

3. 国家自然科学基金面上项目，RNA m⁶A调控R-loop结构稳态作用机制研究，2020/01-2023/12，在研，主持；

4. 国家重点研发计划“发育编程及其代谢调节”重点专项，揭示新型核糖核酸修饰的调控与代谢规律，2019/12-2024/11，在研，任务负责人。

代表论著：

# First Authers，*Corresponding Authers

1. Hui Zhang#, Jiaming Li#, Jie Ren#, Shuhui Sun, Shuai Ma, Weiqi Zhang, Yang Yu, Yusheng Cai, Kaowen Yan, Wei Li, Baoyang Hu, Piu Chan, Guo-Guang Zhao, Juan Carlos Izpisua Belmonte, Qi Zhou, Jing Qu*, Si Wang* & Guang-Hui Liu*. Protein & Cell, 2021, https://doi.org/10.1007/s13238-021-00852-9.

2. He Ming; Chi Xu and Ren Jie*; Applications of Oxford Nanopore Sequencing in Schizosaccharomyces pombe, Methods in Molecular Biology, 2021, 2196: 97-116.

3. Yan Pengze#; Liu Zunpeng#; Song Moshi#; Wu Zeming; Xu Wei; Li Kuan; Ji Qianzhao; Wang Si; Liu Xiaoqian; Yan Kaowen; Esteban Concepcion Rodriguez; Ci Weimin; Belmonte Juan Carlos Izpisua; Xie Wei; Ren Jie; Zhang Weiqi*; Sun Qianwen*; Qu Jing* and Liu Guang-Hui*; Genome-wide R-loop Landscapes during Cell Differentiation and Reprogramming, Cell Reports, 2020, 32(1): 107870.

4. Bi Shijia#; Liu Zunpeng#; Wu Zeming; Wang Zehua; Liu Xiaoqian; Wang Si; Ren Jie; Yao Yan; Zhang Weiqi*; Song Moshi*; Liu Guang-Hui*; Qu Jing*; SIRT7 antagonizes human stem cell aging as a heterochromatin stabilizer, Protein & Cell, 2020, 11(7): 483-504.

5. Hu Huifang#; Ji Qianzhao#; Song Moshi#; Ren Jie; Liu Zunpeng; Wang Zehua; Liu Xiaoqian; Yan Kaowen; Hu Jianli; Jing Yaobin; Wang Si*; Zhang Weiqi*; Liu Guang-Hui* and Qu Jing*; ZKSCAN3 counteracts cellular senescence by stabilizing heterochromatin, Nucleic Acids Research, 2020, 48(11): 6001-6018.

6. Yan Pengze; Ren Jie; Zhang Weiqi*; Qu Jing* and Liu Guang-Hui*; Protein quality control of cell stemness, Cell Regeneration, 2020, 9(1): 22.

7. Wu Zeming#; Shi Yue#; Lu Mingming#; Song Moshi; Yu Zihui; Wang Jilu; Wang Si; Ren Jie; Yang Yungui; Liu Guang-Hui*; Zhang Weiqi*; Ci Weimin* and Qu Jing*; METTL3 counteracts premature aging via m6A-dependent stabilization of MIS12 mRNA. Nucleic Acids Research, 2020, 48(19): 11083-11096.

8. Yang Xin#; Liu Qian-Lan#; Xu Wei#; Zhang Yi-Chang#; Yang Ying; Ju Lin-Fang; Chen Jing; Chen Yu-Sheng; Li Kuan; Ren Jie*; Sun Qianwen* and Yang Yun-Gui*; m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination, Cell Research, 2019, 29(12): 1035-1038. 引用次数：32

9. Liu Minghui and Ren Jie*; Long noncoding RNAs in renal diseases, ExRNA, 2019, 1(1): 27.

10. Zhu Kegan#; Liu Minghui#; Fu Zheng#; Zhou Zhen; Kong Yan; Liang Hongwei; Lin Zheguang; Luo Jun; Zheng Huoqing; Wan Ping; Zhang Junfeng; Zen Ke; Chen Jiong*; Hu Fuliang*; Zhang Chen-Yu*; Ren Jie*; Chen Xi*; Plant microRNAs in larval food regulate honeybee caste development, PLoS Genetics, 2017, 13(8): e1006946. 引用次数：58

11. Ren Jie; Castel Stephane E; and Martienssen Robert A*; Dicer in action at replication-transcription collisions, Molecular & Cellular Oncology, 2015, 2(3): e991224.

12. Castel Stephane#; Ren Jie#; Bhattacharjee Sonali; Chang Anyun; Sánchez Mar; Valbuena Alberto; Antequera Francisco; Martienssen Robert*. Dicer promotes transcription termination at sites of replication stress to maintain genome stability. Cell, 2014, 159(3):572-583. 引用次数：90

13. Ren Jie; Martienssen Robert*. Silent decision: HP1 protein escorts heterochromatic RNAs to their destiny. EMBO Journal, 2012, 31(15):3237-3238.

14. Zaratiegui Mikel; Castel Stephane; Irvine Danielle; Kloc Anna; Ren Jie; Li Fei; Castro Elisa de; Marín Laura; Chang An-Yun; Goto Derek; Cande Zacheus; Antequera Francisco; Arcangioli Benoit & Martienssen Robert. RNAi promotes heterochromatic silencing through replication-coupled release of RNA pol II. Nature, 2011, 479(7371):135-138. 引用次数：155

15. Ren Jie; Wang Chialin; Sternglanz Rolf*. Promoter strength influences the S phase requirement for establishment of silencing at the Saccharomyces cerevisiae silent mating type Loci. Genetics, 2010, 186(2): 551-560. 引用次数：14

（累计被引总计387次。其中 2011年Nature 引用 155 次，2014 年Cell 引用 90次。）

社会任职：
	Peer Reviewed Journal Reviewer (Selected): Cell Reports, EMBO Journal, Current Biology, Molecular Cell, PNAS, Nature Genetics, Nucleus, Genome Research, PLOS One Ad hoc Grant reviewer: Poland National Science Center (OPUS and PRELUDIUM funding schemes)

获奖及荣誉：